کمیساریای عالی سازمان ملل متحد در امور پناهندگان در ایران با دولت ایران و وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی همکاری میکند تا اطمینان حاصل شود که همه پناهندگان به خدمات حیاتی و نجاتبخش دسترسی دارند. کمیساریا از ارائه مراقبتهای بهداشتی اولیه برای همه پناهندگان و پناهجویان، بدون در نظر گرفتن وضعیت قانونی اقامت، هم سطح با شهروندان ایرانی حمایت میکند. خدمات مراقبتهای بهداشتی اولیه شامل واکسیناسیون، مراقبتهای دوران بارداری، سلامت مادر و کودک، تهیه داروهای ضروری و تنظیم خانواده در مراکز بهداشتی در سراسر کشور است. کلیه مراقبت های بهداشتی اولیه برای همه اتباع خارجی مشابه شهروندان ایرانی، رایگان است.
حمایت کمیساریا تحت برنامه مراقبتهای بهداشتی اولیه با همکاری وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی همچنین شامل حمایت از پرسنل درمان و بهداشت، تهیه اقلام و داروهای ضروری پزشکی (در سطح خرید بین المللی و داخلی)، ساخت و احیای مراکز بهداشتی در مناطقی با جمعیت زیاد پناهنده، حمایت از کمپینهای ایمن سازی و واکنش فوری به کنترل و پیشگیری از بیماری های واگیردار می شود. علاوه بر این، کمیساریا از تهیه داروها و تجهیزات پزشکی و ساخت و بازسازی مراکز بهداشتی واقع در استانهای میزبان پناهندگان حمایت میکند.
از سال 2015، به عنوان بخشی از قرارداد مشارکت میان کمیساریا، وزارت کشور و سازمان بیمه سلامت ایران، پناهندگان ثبت نام شده توسط دولت میتوانند به طرح بیمه همگانی سلامت عمومی دسترسی داشته باشند. دیگر پناهندگان می توانند بسته بیمه خدمات درمانی ثانویه و ثالث را با نرخ یارانه ای مشابه شهروندان ایرانی دریافت نمایند . در دوره یازدهم ( 7 اسفند ماه 1403 تا 5 اسفند ماه 1404)، کمیساریای عالی پناهندگان سازمان ملل متحد 100 درصد حق بیمه 95،000 پناهنده آسیب پذیر را در 26 استان ایران پوشش میدهد. باقی جمعیت پناهنده میتوانند با پرداخت هزینه حق بیمه در طرح بیمه درمانی ثبت نام کنند. برای ثبتنام در این طرح، پناهندگان باید به نزدیکترین مرکز پیشخوان/ثبت نام در محل زندگی خود مراجعه کنند.